一、流動(dòng)相不同

　　HPLC為液體流動(dòng)相，GC為性氣體作流動(dòng)相（通常叫做載氣）。

　　二、色譜柱長(zhǎng)不同
　　（1）氣相色譜柱通常幾米到幾十米。
　　氣相色譜儀由于載氣的相對(duì)分析量較低，分子間隙大，故粘度低，流動(dòng)性好，組分在氣相中流動(dòng)速度快，因此可以增加柱長(zhǎng)，以提高柱效）。
　　（2）液相色譜柱通常為幾十到幾百毫米。
　　三、分析種類有差異
　　氣相色譜儀分析的對(duì)象多為（不適）：分子質(zhì)量小于1000，低沸點(diǎn)，易揮發(fā)，熱穩(wěn)定性好的化合物。
　　液相色譜：更適用于分析高沸點(diǎn)，難揮發(fā)，熱穩(wěn)定性差，分子質(zhì)量較大（1000-2000）的液體化合物。
　　四、樣品柱前變化不同
　　氣相色譜的樣品在柱前應(yīng)當(dāng)變?yōu)闅怏w（氣化室汽化），而液相色譜的樣品在柱前則無變化。
　　五、所用檢測(cè)器有差異
　　液相主要為：紫外檢測(cè)器、熒光檢測(cè)器、示差折光檢測(cè)器。
　　氣相色譜儀主要為：氫火焰離子化檢測(cè)器（FID）、熱導(dǎo)檢測(cè)器（TCD）、電子捕獲檢測(cè)器（ECD）、火焰光度檢測(cè)器（FPD）、氮磷檢測(cè)器（NPD）。